오토존에서 다시 알터네이터와 배터리 점검을 받아보세요.
알터네이터를 정품으로 쓰지 않았다면, 몇달 쓰다가 고장나기도 합니다. 재생품들의 품질이 좋지 않아요.
그 정도로 엔진이 흔들리면, check engine 불도 들어왔을 것 같네요. 코드 스캔 해보시구요.
혹시 throttle body 쪽의 air intake 쪽 hose가 loose하거나, 금간 곳이 있는 지 확인해보시구요.
점화플러그 중 하나가 이상이거나, 이그니션코일이 나간 경우도 그런 현상이 나타납니다.