회계사가 ITIN을 가진 와이프와 join filing을 하려면 paper 1040을 작성 해야 한다는데, turbo tax 또는 efiling은 안되는 것인가요? 이 회계사는 안된다고 하던데….이해가 안갑니다.

당연히 가능합니다..
회계사가 초보이거나 e-filing 비용 절약 하려는것 같습니다..
보통 회계사 비용에 e-filing 비용을 포함해서 받고 고객이 원하면 e-filing 해주는 경우가 많다고 합니다..e-filing 안하면 그 비용은 회계사 몫이 되겠지요..