아이 학교 등록 때문에 부모 정보를 등록하는데요, Custodial을 체크를 하는 칸이 있더라구요. 이 칸은 일반 가정에는 해당되지 않고 이혼한 경우에 양육권 문제 때문에 있는건가요?

주로 foster child에게 해당 되겠지요. 아님, 조기유학등으로 법적인 보호자 관계이거나

네, 친권자임을 확인하기 위해서 입니다. 혼인중에 있는 친어머니 친아버지 부부는 공동 친권자임으로 인정됩니다.