제가 대한항공 스카이패스 계정이 있고, 외환카드로 되어있습니다.
스카이패스 계정은 같게 하고, 신한카드에서 카드를 발급 받을 수 있나요?

즉 스카이패스 계정은 하나, 카드는 두개로 만들어서 사용할 수 있나요?

상관없습니다. 신한카드 신청할 때 스카이패스 번호 넣는 란에 기재만 하는 것입니다.