현재 학생비자(F-1)로 있구요, 2008년 말에서 2009년 초에 산 주식들이 수익이 꽤 났습니다. 지금도 그 주식들 다 hold 하고 있구요.
내년초(2010년 2 ~ 5월쯤)에 한국으로 영구 귀국을 하게 될것같은데요. 그 전에 주식을 다 처분해야겠지요.

주식이란게 앞으로 어떠게될지 모르지만, 만약에 수익이 있다면 세금(long term capital gain, 수익의 15%) 을 내고 가야되나요?

어디서 들은(?) 얘긴데, 외국인은 미국 체류기간이 1년에 6개월미만 이면 세금이 면제된다고 하던데요.

세금면제는 님에게는 전혀 해당 사항이 없습니다.
일단 소셜 넘버가 있는지 없는지에 따라 다릅니다.
만약 소셜넘버가 없는 외국인이면 일단 주식거래회사에서 세금을 withholding 하게 되어 있습니다.

즉, 세금을 안내려고 해도 어차피 세금은 원천징수하게 되어 있죠.

더더구나, 세금보고는 선택이 아닌 의무사항이므로 나중에 미국에 다시 들어올 생각이 있으시면 반드시 하셔야 합니다.

다음 설명을 보면…
* invest-faq.com/cbc/tax-non-us-nat.html

연방세법상 Nonresident Alien의 경우,
주식투자 Capital Gain에 대한 연방세금은 …

– Nonresident Alien, 183일 이상 체류 (F,J 등) : 30% tax
– Nonresident Alien, 183일 미만 체류 : No tax
라고 나옵니다.

제가 한달 전에 이와 관련된 댓글을 쓴 적이 있는데요.
그때는 한국인은 Nonresident Alien이라면 183일 이상 체류해도 주식 투자 수입에 대해 세금을 내지 않는 것으로 생각했었는데,
지금 한미세금협정 16조 (1)(c)를 다시 읽어 보니,
한국인도 183일 이상 체류하면 주식 투자 이익에 대해서 세금을 내야하는 것으로 보입니다.

물론, 위에 쓴 것처럼 해당 연도에 183일 미만 체류한 Nonresident Alien은 주식 투자 수입에 대해서 연방 소득세를 내지 않습니다.

그러므로,
원글님이 5년차 이하의 F1 유학생으로 연방세법상 Nonresident Alien이고
(즉, Form 1040NR, 1040NR-EZ 중의 하나로 연방 세금 신고하는 사람이고),
내년에 주식을 팔고 6월 이전에 출국을 하면 (즉, 2010년에 183일 미만 미국 체류하면)
연방세금에서 Capital Gain Tax를 내지 않는다고 생각합니다.

물론, Resident Alien이면 (즉, Form 1040, 1040A, 1040-EZ 중의 하나로 연방 세금 신고하는 사람이면) 보통의 Capital Gain Tax가 있습니다.

만약 내지 않는 세금을 원천징수하였다면
Tax Return (연말 세금 정산) 신고 때 돌려 받을 수 있을 것입니다.

State income tax는 어떻게 될지 잘 모르겠습니다.

참조:
—
http /www.irs.gov/businesses/small/international/article/0,,id=129253,00.html
The Taxation of Capital Gains of Nonresident Alien Students, Scholars and Employees of Foreign Governments

Nonresident alien students and scholars and alien employees of foreign governments and international organizations who, at the time of their arrival in the United States, intend to reside in the United States for longer than 1 year are subject to the 30 percent taxation on their capital gains during any tax year if during such tax year (usually calendar year) they are present in the United States for 183 days or more, unless a tax treaty provides for a lesser rate of taxation.

—
http /www.irs.gov/businesses/small/international/article/0,,id=96404,00.html

Capital Gains
If you were present in the United States for 183 days or more during the tax year, and you are still a nonresident alien, your net gain from sales or exchanges of capital assets is taxed at a 30% (or lower treaty) rate. For purposes of the 30% (or lower treaty) rate, net gain is the excess of your capital gains from U.S. sources over your capital losses from U.S. sources.

—
세금협정

http /www.irs.gov/pub/irs-pdf/p901.pdf
Publication 901. U.S. Tax Treaties

http /www.irs.gov/businesses/international/article/0,,id=169602,00.html
Korea – Tax Treaty Documents

—
Resident/Nonresident에 대해서는…

http /sorine.kseane.org/sorine_tax_faq.html
(7) 세금신고에서 Resident란 영주권자인가 ?

돈 받고도 이렇게 자세히 알려주시기는 어려울 텐데요…