멕시코나 캐나다와 같은 접경 국가에 다녀올 때는 두가지 선택사항이 있습니다.

(1) 출국 때 I-94를 반납하지 않고, 재입국 때 그것을 보여주고 그대로 사용합니다.
즉, 새로운 I-94를 받지 않습니다.

원글님이 들으신 것은 이것으로 보입니다.
예전에 입국시 받았던 F1이라고 써있는 I-94는 E2로 체류신분 변경을 할 때 이미 무효화 된 것입니다.
이 경우에 재입국시 제시하는 I-94는 당연히 기존의 유효한 것, 즉 E2 체류신분의 것이어야 합니다.

이것은 마치 출국을 하지 않았었던 처럼 기존의 체류신분을 그래로 유지하는 것으로서
입국 시 유효한 비자 스탬프가 없어도 되고, 기존의 I-94도 바뀌지 않습니다.
당연히 이 방법으로는 체류신분이 변경되지 않습니다.
그러므로, 원글님처럼 재입국을 통해서 F1으로 바꾸려고 하는 경우에는 사용할 수 없는 방법입니다.

참고로, 이렇게 유효한 비자 스탬프가 없이도 재입국을 할 수 있는 것을
Automatic Visa Revalidation이라고 부릅니다.

https://www.workingus.com/v2/gnu/bbs/board.php?bo_table=visa&wr_id=167738

다른 방법으로…
(2) 출국 때 I-94를 반납하고 재입국 때는 비자 스탬프를 사용해서 입국 심사를 받고 새로운 I-94를 받습니다.
출국 때 I-94를 반납하는 것이므로, 입국 때 어느 I-94를 보여줘야 하냐 하는 질문은 의미가 없는 것이지요.

(미국 내에서 체류신분 변경을 하여 승인서에 인쇄되어 오는 I-94는 입국 때 받았던 기존의 I-94와 번호가 같습니다.
둘다 반납하는 것이 원칙이지만, 둘다 번호가 같기 때문에 하나만 반납해도 별 문제가 없다고 합니다.)

이것은 한국에 다녀오는 것과 마찬가지 입니다.
또는, 처음 새롭게 입국하는 것과 마찬가지라고 생각할 수도 있습니다.

기존의 유효한 비자 스탬프가 살아 있으면 그것을 사용하고
(물론 재입국 때의 입국 목적이 그 비자 스탬프에 맞는 것이어야 함),
만약 유효한 비자 스탬프가 없으면 새로운 비자 스탬프를 받아 와야 합니다.

아무래도 원글님은 아직도 기본적인 사항들에 대해서 정확히 알고 계시지 못한 것 같습니다.
그리고, 사실은 재입국 때 F1으로 입국하겠다는 것도
정말 공부를 하러 입국하는 것이 아니라 편법에 의한 체류 연장을 위한 것이고
입국 후 또 다시 다른 체류신분으로 변경할 의도를 가지고 있다고 의심을 받을 가능성이 있어 보입니다.
경우에 따라서는 체류기간을 짧게 주거나, 입국 후 체류신분 변경 불가 도장을 찍거나 아예 입국을 금지할 수도 있습니다.
또, 지난번 말씀드린 것처럼 예전 비자 스탬프 자체에도 트집을 잡을 가능성도 있다고 생각됩니다.

아무래도 변호사와 상담을 해서 최선의 방법을 찾아보는 것이 좋지 않을까 생각합니다.
(저는 비전문가로서, 모르는 분에게 개인적으로 상담을 드리기는 곤란합니다.)

소리네님의 말씀이 맞습니다. 변호사와 상담을 하시는 것이 좋습니다. F1을 받은 후에 E2로 신분 변경을 하고.. 다시 원래 F1을 쓸 수 없는지에 대해 질문하신 것인데… 그것은 불가능합니다. 기존에 신분변경을 신청하여 받아들여졌기 때문에 이전의 F1의 신분자체가 없어진 것입니다.
따라서 F1으로 입국하실 때 발급받았던 I-94도 전산상에서 없어져버립니다.