저도 비슷한 경우로 2000을 지웠습니다.

먼저 2000에 깔려있는 불필요한 프로그램을 지우시고,

C:에 보면 BOOT.INI라는 파일을 열어 보면 XP와 2000에 대한 Dual Booting 정보가 있습니다.

이중 2000 부분을 지우시고 (Restart)

그리고 WINNT 디렉토리를 없애시면 될 겁니다. XP는 WINDOWS라는 디렉토리를 사용합니다.

이건 제가 한 방법인데… 혹시 잘못 될 수도 있으니 필요한 자료는 백업하시고 하시길…